# Localization Prediction using LocTree3 # Note: chloroplast and plastid classes are valid for plant proteins only. # Therefore, if the origin of a non-plant protein is known, please consider predictions of these classes as mitochondrial. # Domain: euka # # NOTATION Protein Id: Fasta sequences Id truncated by whitespace # NOTATION Score: Reliability score on a 0-100 scale (0=unreliable & 100=most reliable) # NOTATION Localization: Predicted sub-cellular localization class # NOTATION Gene Ontology Terms: Gene Ontology (GO) term/s of the corresponding localization. GO terms predicted by PSI-BLAST are supported by evidence codes (see http://www.geneontology.org/GO.evidence.shtml) # # PSI-BLAST annotation based on Swiss-Prot release 2013_11. # Protein Id Score Localization Gene Ontology Terms sp|P48200|IREB2_HUMAN 100 cytoplasm cytoplasm GO:0005737(NAS); cytosol GO:0005829(IEA); mitochondrion GO:0005739(IEA); sp|P09326|CD48_HUMAN 12 plasma membrane external side of plasma membrane GO:0009897(IEA); integral to membrane GO:0016021(IEA); sp|Q8TC90|CCER1_HUMAN 13 nucleus mitotic spindle pole body GO:0044732(IDA); nucleus GO:0005634(IDA); tr|F8WB74|F8WB74_HUMAN 99 cytoplasm mitochondrion GO:0005739(NAS); sp|Q9NNX9|VCX3_HUMAN 29 cytoplasm cornified envelope GO:0001533(IDA); cytoplasm GO:0005737(IDA); sp|O00264|PGRC1_HUMAN 30 secreted extracellular space GO:0005615(IDA); sp|Q8IZD0|SAM14_HUMAN 18 cytoplasm axon GO:0030424(IDA); cytoplasm GO:0005737(IEA); sp|P17987|TCPA_HUMAN 100 cytoplasm acrosomal vesicle GO:0001669(IEA); cell junction GO:0030054(IDA); centrosome GO:0005813(IDA); 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